Thảm thực vật tại đây chủ yếu là các loài ven biển bao gồm dừa, dứa dại, phi lao, nhàu, bàng vuông, xa kê, bàng, xoài biển và thực vật rừng ngập mặn.[2]

Thảm thực vật biển thường thấy bao gồm các loài rong, tảo biển như tảo đỏ, tảo lục, tảo nâu, cỏ biển, rong hải cốt, rong mơ.[2]

Về động vật, vườn quốc gia bao gồm 54 loài sinh vật biển tạo thành một phần của hệ sinh thái san hô, 144 loài cá, 2 loài sò tai tượng, một số loài giun biển với nhiều màu sắc khác nhau và 17 loài chim ven biển.[2] Đặc biệt, đây là nơi sinh sản quan trọng của hai loài rùa biển là đồi mồi và đồi mồi dứa. Trứng của chúng sẽ ấp bán tự nhiên và sau đó những cá thể con sẽ được nuôi dưỡng trên đảo Pramuka trước khi thả về với tự nhiên nhằm phục hồi quần thể các loài rùa biển đang đứng bên bờ vực tuyệt chủng.[2] Tại các khu rừng ngập mặn ven biển, một số loài động vật khác được tìm thấy gồm kỳ đà hoa, rắn rào cây, trăn gấm.[2]